男性不育的治疗要针对病因、不育的时间、年龄和患者自己的选择决定。同时，配偶也需要进行检查或者治疗，有时候只需要对不育的男性患者的配偶进行治疗就能受孕。主要治疗方式包括：
抗感染
血常规提示感染者需要抗感染治疗，但感染治愈不等于不育治愈了。
对性生活问题的治疗
如勃起功能障碍和射精功能障碍等的治疗有助于治疗不育。
激素治疗
雄激素水平高或低的患者就需要调整雄激素水平至正常。
手术
伴有精液常规异常的精索早泄者需行精索静脉高位结扎术，隐睾或睾丸下降不全者可行睾丸下降固定术，以促进睾丸的生精功能。
中医中药治疗
对于1度的精索早泄、精液感染（含前列腺炎、精囊炎、附睾输精管炎）、免疫性男性不育症，采用中医中药辨证治疗，或活血化瘀，或清肝补肾，或补肾益精，或疏肝调冲。
辅助生殖技术
对重度睾丸精子生成功能障碍，常规治疗不能改善，或睾丸精子生成功能良好但输精管道缺损或堵塞、逆行射精而常规治疗不能改善的患者可采用体外受精等辅助生殖技术受孕。
